本中心與不同研究及其他相關機構有緊密合作，透過互相交流意見及專業知識，提升本中心的研究工作水平。以下為本中心的伙伴機構：

HONG KONG AND TAIWAN PUBLIC ADMINISTRATION RESEARCH CENTRE

FUDAN UNIVERSITY

上海復旦大學港台行政研究中心

URBAN & REGIONAL DEVELOPMENT RESEARCH INSTITUTE

TUNGHAI UNIVERSITY

台灣東海大學都市暨區域發展研究中心